Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms