Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF3Q9NRP4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms