Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-211ENST00000436447 3003 ntTSL 520.55■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-215ENST00000457926 2919 ntTSL 220.38■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TCF3-216ENST00000592395 996 ntTSL 519.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CASP9-207ENST00000447522 954 ntTSL 319.85■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-213ENST00000470519 834 ntTSL 519.57■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 PALM-206ENST00000589012 579 ntTSL 319.48■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ARMCX3-206ENST00000491568 973 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.77e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-221ENST00000495095 575 ntTSL 419.16■□□□□ 0.664e-8■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ATP6V0D1-211ENST00000565835 905 ntTSL 319.07■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 418.92■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-219ENST00000494358 578 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.614e-8■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CENPT-204ENST00000562338 583 ntTSL 418.83■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-204ENST00000421164 1706 ntTSL 1 (best)18.83■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-15■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.524e-6■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 NEK7-205ENST00000442588 519 ntTSL 517.66■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 THOC3-206ENST00000513006 602 ntTSL 317.26■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CENPT-228ENST00000568564 537 ntTSL 417.22■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-210ENST00000572498 858 ntTSL 217.18■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 517.16■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 PALM-209ENST00000592870 1346 ntTSL 217.04■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MYO1D-205ENST00000577576 581 ntTSL 317.04■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ARMCX3-205ENST00000479298 637 ntTSL 516.95■□□□□ 0.37e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 RBBP5-203ENST00000484379 367 ntTSL 216.82■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ITGB1-211ENST00000475184 552 ntTSL 416.8■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.267e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-209ENST00000459630 765 ntTSL 516.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ITGB1-204ENST00000417122 569 ntTSL 416.63■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TCF3-211ENST00000587425 629 ntTSL 216.24■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.167e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-204ENST00000361846 4348 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-222ENST00000490715 4483 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CLN6-215ENST00000636674 2005 ntTSL 515.48■□□□□ 0.077e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.057e-13■■■■■ 139.7
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UTP3Q9NQZ2 CENPT-222ENST00000566067 631 ntTSL 314.82□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ARID1B-208ENST00000493658 974 ntTSL 314.81□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CEP72-204ENST00000514507 897 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.127e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-205ENST00000421780 526 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-206ENST00000423684 595 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.146e-21■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 BAIAP2-229ENST00000576995 3689 ntTSL 214.15□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-202ENST00000388970 1466 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 139.7
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UTP3Q9NQZ2 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 139.7
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UTP3Q9NQZ2 RAB2B-202ENST00000417141 559 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.287e-13■■■■■ 139.7
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UTP3Q9NQZ2 ARMCX3-201ENST00000341189 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 SLC38A10-209ENST00000546352 580 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 RAB2B-205ENST00000485996 443 ntTSL 213.09□□□□□ -0.317e-13■■■■■ 139.7
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UTP3Q9NQZ2 ERGIC2-203ENST00000546839 1274 ntTSL 512.47□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-210ENST00000463235 2574 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 POLDIP3-203ENST00000348657 3323 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.457e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 AFG3L1P-216ENST00000458301 2298 ntTSL 212.18□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 POLDIP3-201ENST00000252115 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.467e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 POLDIP3-205ENST00000451060 3491 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.477e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ERGIC2-210ENST00000552132 695 ntTSL 312.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 THOC3-210ENST00000514861 628 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ST7L-203ENST00000360743 4206 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MTIF3-205ENST00000461838 947 ntTSL 311.65□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 PLAGL1-221ENST00000629890 584 ntTSL 411.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TATDN1-219ENST00000523888 591 ntTSL 311.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 RAB2B-204ENST00000475857 621 ntTSL 211.25□□□□□ -0.617e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MTIF3-204ENST00000460973 785 ntTSL 510.97□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TTLL3-224ENST00000471058 543 ntTSL 210.94□□□□□ -0.666e-21■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MTIF3-201ENST00000381116 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TATDN1-212ENST00000522280 684 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MDC1-202ENST00000416571 582 ntTSL 310.62□□□□□ -0.716e-21■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 THOC3-205ENST00000511062 642 ntTSL 310.59□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 MTIF3-210ENST00000485650 798 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.757e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 POLDIP3-204ENST00000445215 3337 ntTSL 1 (best)10.14□□□□□ -0.797e-13■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 CENPT-214ENST00000564538 501 ntTSL 410.13□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 TAF8-205ENST00000465926 1222 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 139.7
UTP3Q9NQZ2 THOC3-204ENST00000510300 699 ntTSL 59.86□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 139.7
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