Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLMQ9NP87 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms