Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM27Q9HBJ8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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