Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MTMR12Q9C0I1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms