Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NDFIP1Q9BT67 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms