Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX2Q99697 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms