Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NSMCE2Q96MF7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms