Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC7Q96M83 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC7Q96M83 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms