Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LCORQ96JN0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LCORQ96JN0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms