Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms