Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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RNF185Q96GF1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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