Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113Q902F9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms