Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSRNP3Q8WYN3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSRNP3Q8WYN3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms