Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKAP1Q86WV1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKAP1Q86WV1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms