Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms