Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C15orf39Q6ZRI6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms