Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBLN3Q6UW01 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBLN3Q6UW01 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms