Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RWDD4Q6NW29 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RWDD4Q6NW29 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms