Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LRRC8EQ6NSJ5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LRRC8EQ6NSJ5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms