Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM198Q66K66 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms