Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FAM78BQ5VT40 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FAM78BQ5VT40 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FAM78BQ5VT40 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FAM78BQ5VT40 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FAM78BQ5VT40 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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