Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms