Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms