Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ODF4Q2M2E3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ODF4Q2M2E3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms