Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RTL8BQ17RB0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RTL8BQ17RB0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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RTL8BQ17RB0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RTL8BQ17RB0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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