Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SGCAQ16586 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SGCAQ16586 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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