Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC18A3Q16572 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A3Q16572 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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