Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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EXT1Q16394 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXT1Q16394 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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