Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX1Q16384 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SSX1Q16384 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX1Q16384 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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SSX1Q16384 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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SSX1Q16384 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSX1Q16384 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SSX1Q16384 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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SSX1Q16384 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSX1Q16384 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSX1Q16384 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSX1Q16384 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSX1Q16384 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSX1Q16384 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSX1Q16384 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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