Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC23BQ15437 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms