Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ANKRD1Q15327 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ANKRD1Q15327 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms