Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDCD1Q15116 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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