Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
EXOSC2Q13868 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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