Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOFQ13790 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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APOFQ13790 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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APOFQ13790 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOFQ13790 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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