Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMAD4Q13485 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMAD4Q13485 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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