Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PTP4A2Q12974 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTP4A2Q12974 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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