Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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