Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
POLEQ07864 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
POLEQ07864 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
POLEQ07864 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
POLEQ07864 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
POLEQ07864 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
POLEQ07864 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
POLEQ07864 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POLEQ07864 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
POLEQ07864 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
POLEQ07864 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms