Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNEQ04844 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms