Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ARID5AQ03989 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms