Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2F1Q01094 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms