Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HTRA4P83105 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HTRA4P83105 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms