Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HERVK_113P62684 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms