Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00313P59037 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms