Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN15P56746 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms