Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNA2P51530 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DNA2P51530 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DNA2P51530 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DNA2P51530 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms