Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYB561P49447 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYB561P49447 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms