Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms